Благодаря системе гидросооружений придунайские озера наполняют водой из реки Дунай.

Большинство шлюзов открыто, но это не касается шлюзов Скунда, 105 км и Репида, через которые дунайская вода может попасть во взаимосвязанную гидросистему озер Кугурлуй и Ялпуг.

Согласно данным Измаильского управления водного хозяйства о гидрологическом состоянии р. Дунай и Придунайских водохранилищ на 14.10.2024, уровень воды в озерах Ялпуг и Кугурлуй на 62 см ниже нормального подпорного уровня (оптимальной наивысшей отметки водного объекта, которая может поддерживать в нормальных условиях эксплуатацию гидротехнических сооружений).

Что касается других озер, то благодаря открытым шлюзам уровень воды в них постепенно поднимается.